היחידה המרכזית מרכזת ומתאמת פעילות מנהלית תקנונית וביצועית הנוגעת לנהלי הוראה ולימודים, רישום תלמידים לתוכניות הלימודים, דיווח ציונים, מדרגי סיום ומדרגי הצטיינות. כמו כן, המדור אחראי גם על טיפול בחריגים ועוסק בהדרכת משתמשים ובבקרה בתחומי פעילותו.
היחידה עובדת בתיאום עם הפקולטות ובתי הספר ועם המחלקה למערכות מידע.
בנוסף, היחידה מטפלת באימות תארים מול מוסדות להשכלה גבוהה בחו"ל ומקומות עבודה בארץ ובחו"ל.